Saat ini SMP Istiqomah Sambas Purbalingga (Boarding dan Reguler) dipimpin oleh Bapak Syaefudin Purwanto, S.Pd. selaku Kepala Sekolah.
Beliau menamatkan Sekolah Pendidikan Guru (SPG) Negeri Purwokerto pada tahun 1990, meneruskan kuliah pada tahun 1997 di Universitas Islam As-Syafi’iyah Pondok Gede. Bergabung dengan Lembaga Pendidikan Istiqomah Sambas Purbalingga mulai tahun 2007.